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preLights采访Sarvenaz Sarabipour

2021年11月15日

Sarvenaz Sarabipour是美国马里兰州巴尔的摩市约翰霍普金斯大学的助理研究科学家。她在约翰霍普金斯大学获得工程学博士学位,主要研究细胞和组织水平的受体信号网络。除了科学兴趣,她还积极倡导早期职业研究人员、开放科学、导师制和科学多样性。我们采访了Sarvenaz,了解了她的研究生涯,以及她在学术文化和科学传播方面令人印象深刻的工作。

一个好的开始是思考是什么引导你从事科学研究!你的兴趣从何而来?你本科学的是什么?

在我上六年级的时候,我们学校的科学教科书中有一章提出了一个问题,老师让我们思考:为什么雨后我们会在土壤表面看到蚯蚓?

当然,有几种可能。他们会溺水吗?雨水会促使蠕虫大规模迁徙吗?或者它们缺少氧气?这是我们第一次受到独立思考的挑战,我发现围绕它们的行为有多种可能的答案和不确定性,这真的很有趣。这激发了我对科学的兴趣,从那时起,我决心成为一名科学家,并攻读物理学和数学学位。我在伊朗出生和长大,但我在澳大利亚悉尼大学获得了本科学位,然后搬到加拿大攻读硕士学位。

然后你在约翰霍普金斯大学.你能告诉我们你在做什么吗?你的主要发现是什么?

本科毕业后,我选择了一个不同的方向,我没有选择天体物理学、凝聚态或医学物理学的课程,而是把我的工作转向了更基本的生物物理学问题。当我还在上高中的时候,我和我的父亲有过一次对话,他是一位心脏病学家,关于癌症和心血管疾病的不同分子疗法。他提到了一种名为赫赛汀(Herceptin)的药物,这是一种针对来自受体酪氨酸激酶家族(RTK)的细胞表面蛋白HER2的抗体,是一些癌症患者的处方药物。然而,对一些患者来说,赫赛汀会导致心脏问题,而且医生们也不知道这种药物是如何影响HER2信号或细胞功能的。这让我意识到,首先,我们甚至不知道HER2受体是如何在细胞表面发挥作用的,不管有没有治疗方法,其次,我们不知道通过治疗干预来修改HER2会有什么影响,无论是在目标组织(在癌症治疗中)还是在其他组织,如心脏,在系统水平上。

我开始研究RTK家庭在我博士工作并发现成纤维细胞生长因子受体(FGFRs)和血管内皮生长因子受体(VEGFRs)成员在野生型和突变型中具有不同的二聚热力学,配体诱导了控制报告基因功能的受体二聚体的不同结构变化。

你现在的博士后研究方向是什么?

我的博士后工作是系统生物化学和计算建模,并研究了RTK与配体和辅助因子相互作用的更复杂网络如何控制细胞功能。具体来说,我正在模拟VEGF受体家族的成员,它们参与调节内皮细胞的行为和新血管的形成。最终的目标是阐明如何利用VEGF的相互作用来改善治疗结果,并确定帮助患有肢体缺血的外周动脉疾病患者血液灌注的机制。

为了学业,你们走遍了世界各地;这是你喜欢做的事情吗?

是的,我从小就把英语作为第三语言来学习,并且一直希望到讲英语的国家学习。澳大利亚是一个很好的选择,因为它的科学声誉,我很高兴我有机会搬这么多地方。科学不是一个小社区,科学家的观点是如此不同。我对不同国家的科学家的观点很感兴趣,我能从他们的实践和研究文化中学到什么,我希望我能利用这些找到我自己做科学的方法,希望未来能和我自己的团队一起做科学。这是一个挑战,当你做出巨大的改变时,总是有一个陡峭的学习曲线,但我也在我的研究学科上做了很大的改变,我的硕士学位从物理和数学转向物理化学,然后我的博士学位转向生物物理学和生物化学。

你也留在约翰霍普金斯大学做博士后研究。你喜欢那里的研究环境吗?

对于科学家来说,我认为你的动作会受到某一特定学科工作人员的影响。博士毕业后,我对研究人类生物学和医学的系统级和计算方法非常感兴趣,而我的博士工作主要是实验性的。我的实验背景对我的计算建模很有帮助,正是这种结合让我对和我现在的导师一起工作很感兴趣,我想如果我搬到其他地方,我就会错过一个绝佳的机会。我不认为改变制度总是正确的做法。

换到工作的另一边。你是一个eLife的早期职业研究顾问并撰写了大量关于学术文化、开放科学和可复制性的论文和文章。是什么激励你在从事科学研究的同时追求这些兴趣?

对我来说有两个关键的启发:我个人希望作为一名早期职业研究员(ECR)来改善研究文化和我们的研究社区,以及我有幸在ECR工作的优秀研究员的热情和奉献eLife社区未来PI Slack集团.eLife社区是由eLife发起的,旨在将全世界有兴趣讨论我们工作和文化中的挑战的ecr聚集在一起,寻找讨论这些问题的方法,并为它们提出解决方案。几年前我加入了Future PI Slack小组,现在我在领导这个小组,从某种意义上说,我希望能让博士后的经历更愉快,并建立一个社区。

我认为ecr通常对我们希望研究企业如何在短期和长期内发展抱有希望,我们希望参与到有关这方面的讨论中。然而,这些讨论并没有真正以可见的方式发生,我认为导师在这些活动中支持ecr是很重要的。我要感谢我的导师,Feilim Mac Gabhann博士在约翰霍普金斯大学支持他的所有学员在这些其他方面的努力,而且很高兴看到期刊也开始发表关于ecr研究文化的文章。

你写的其中一篇论文如何保持工作与生活的平衡作为一个学术。是什么促使你专注于此,你会给那些被他们的研究项目的需求所淹没的ecr什么建议?

这项工作来自于我和ecr在eLife社区领导的指导和领导计划。我们希望强调的是,研究人员的许多习惯都源于焦虑、缺乏时间和任务管理,以及生活和工作之间没有个性化的平衡。本文旨在讨论这些问题,并指出个人可以做些什么。工作很长时间并不一定意味着他们是多产的时间,所以如果ecr可以通过保持工作和休闲时间的平衡来提高他们的工作质量,这对每个人都是有益的。

我们还提前讨论了如何平衡工作与生活。ECR行为通常会受到实验室或部门文化的影响,但重要的是你要掌控自己的职业生涯,不要贬低自己的时间价值,也不要让工作环境左右你的行为。

最后,如果没有支持,就很难制定计划或战略,所以找到优秀的导师并寻求他们的建议是关键。同侪支持小组也可以提高学术生活的质量,我强烈推荐针对职业水平的Slack小组:Grad Slack, Future PI Slack, New PI Slack, midcareer PI Slack。

你提到了焦虑,我认为ecr焦虑的另一个重要来源是会议和社交。你写过关于会议的文章2019冠状病毒病大流行意味着向在线活动的重大转变,但我们如何考虑以“更好的方式”开展这些活动,以支持ecr和促进可访问性?

这是一个我思考了很久的问题。作为一名移民科学家,我觉得在流动和合作研究方面机会很少。这可能是获得旅行签证的成本和过程,或者当你们有不同的语言和文化背景时,愿意就科学展开公开讨论。

作为一组来自六大洲的ecr,我们调查了2018年至2019年期间在物理科学、生命科学、工程和医学等领域举行的250多场面对面会议,发现了许多可以改进的方面。大多数会议在组织、科学委员会和邀请演讲者方面缺乏性别平衡,它们产生了数百万吨的碳排放,每年总共花费数十亿美元。ecr很少有机会参加会议,即使我们参加了会议,其设置也不适合进行交互。这影响到所有研究人员,特别是ecr、妇女、残疾研究人员、国际学者和有脆弱性或护理责任的研究人员。来自2020 - 2021年的数据这表明虚拟会议实际上提供了更多的访问和互动机会。在预印本出现之后,我认为虚拟会议是我职业生涯中学术界经历的最好的变革。混合会议(结合了亲自出席和虚拟出席)可以将聆听和展示研究从网络中分离出来,我们还需要考虑新的网络方法,因为你也不可能在仅仅几天的会议上进行适当的讨论。高质量的、长达一年的网络可以通过由草根运动和科学团体推动的在线社区来支持,我对研究文化的这种变化感到非常兴奋。

这就很好地引出了预打印!你写过关于ecr预印本的好处而且作者反驳有人认为预印本损害了公众对科学的认知。你为什么如此强烈地支持预印本?

我支持预印本,因为它们使我们能够以新的、影响深远的方式迅速传播科学。我还认为,预印本可以启动国际讨论,并允许围绕期刊文章进行以前没有的对话。我们写的关于会议的论文是在2020年4月作为预印本发布的,比它最终发表在期刊上早了一年,正好是在会议走向虚拟的那段时间。看到这个预印本在网上被讨论,我真的很兴奋,它甚至作为一个preLights帖子得到了很多关注。学术界的许多方面,包括学术出版、资助、招聘和职业发展,都受到了长周期的同行评审、编辑和其他期刊决策的阻碍,但这对ecr的影响最大。预印本积极地改进、支持、告知、补充和促进研究和研究文化的许多方面,而这一切都预示着我们在开展和传播科学方面的文化转变,以及为ecr提高学术水平。

有趣的是,你在COVID-19大流行之前写了反驳文章。媒体对covid相关预印本的描述是否让你有了不同的想法?

我认为,记者和媒体必须在确保研究结果的准确表述在媒体中得到报道上进行合作。新科研的媒体报道的解决方案不是停止预印本!记者的责任是与作者和该领域的其他专家接触,进行知情的讨论,并仔细选择他们的措辞。这是一个巨大的责任,我认为在大流行期间,在某种程度上管理不当,但这不足以成为阻止共享科学工作的理由。这种情况也可能发生在同行评议的文章中,仅仅因为预印本处于聚光灯下,并不意味着它们有内在的缺陷。

预印本为科学家、临床医生和权威机构之间的同行评审和讨论提供了一个开放的途径,并且只对所有参与者有帮助。

最后,你接下来要做什么?

我希望留在学术界,我认为学术界在我所从事的领域有很大的机会。系统生物学是一个相对较新的研究领域,但它有可能检查不同领域的研究,并以以前不可能的方式将它们结合在一起。在计算工作中,你可以开始重新想象这个领域,因为你不受仪器或试剂资金的限制,我认为这对该学科的未来来说是非常令人兴奋的。医学还没有完全看到系统生物学和计算医学能提供什么,我很高兴能成为其中的一部分。

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